三类医疗器械许可证办理手续:1、经营单位经办人员带上三类医疗器械公司批准申请表格、证明文件、企业营业执照或名称预先核准证明材料影印件前去所在城市设区的市市人民政府食品药品监管部门申请办理经营许可证;2、相关工作人员审理材料,并且于30个工作日日内进行核查,如果需要机构审查;3、对符合要求要求的,批准许可并发送给三类医疗器械许可证书;对不符合要求要求的,不得批准并书面说明原因。